结论：注销前往来款两头都要有着落——应收款要么收回、要么凭证据核销；应付款要么付掉、要么确认无法偿付转入营业外收入计税。挂在那里不动的往来科目，是注销清税环节被卡住最常见的原因。
第一层：应收款，收不回不等于可以随手核销。
收回的部分正常入账；确实收不回的，作为资产损失在税前扣除需要证据支撑。《企业资产损失所得税税前扣除管理办法》（国家税务总局公告 2011 年第 25 号）第二十二条至第二十四条规定的口径是：债务人死亡、依法宣告失踪且其财产不足清偿的，凭相关证明扣除；逾期三年以上、有依法催收记录且确认无法收回的，凭专项说明扣除；因债务人破产清算的，凭破产公告或清算文件扣除。注销时把大额应收款一笔“直接核销”而拿不出催收记录和证明材料的，税务机关有权不允许扣除，损失调增后清算所得随之增加。日常经营期间往来款挂账的监控口径，见站内《公司账上往来款一直挂着，会有什么问题》一文。
第二层：应付款，付不出去反而是收入。
《企业所得税法实施条例》第二十二条将确实无法偿付的应付款项列入其他收入范围，要并入清算所得计征企业所得税。注销前账面挂着应付账款、其他应付款的，逐笔确认三种去向：正常支付清偿；与债权人协商减免，差额转营业外收入；债权人已注销、失联且无追索的，凭证据转入收入。把应付款转到股东个人名下再从私人账户清偿的，实质是公司资产向股东的转移，个税与企业所得税两头都会被追问。
第三层：股东往来是单独一档风险。
股东向公司借款，注销前未归还也未用于经营的，按财税〔2003〕158 号的规定，纳税年度终了后既不归还又未用于生产经营的，视同企业对股东的红利分配，按 20% 代扣个人所得税；公司侧对应的应收款还要再走一遍核销证明的流程。反方向，股东欠公司出资未实缴的，清算时这部分债权实际拿不到，公司债权人有权要求股东在未出资范围内补充清偿，清算组要同步把出资情况核实清楚。认缴出资在清算环节的责任口径，见站内《公司注册资本认缴了，代理记账怎么提示风险》一文。
第四层：注销环节的时点与配合。
往来款的清理要在清算组成立后、注销税务登记前完成：清算组应书面通知已知债权人并公告，债权申报与债务清偿按《公司法》清算程序执行；税款、滞纳金、罚款在申请清税证明前全部结清。往来款用公户还是私人账户收付，以账户主体是否为公司为准，混合收付的流水会直接影响清算核对。
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